两者的稀释剂不同，水性三防漆是以水作为稀释剂，而纳米涂层则恰恰不能掺水，需使用原厂的稀释剂，水表真空镀膜高分子防水材料，为了保证产品的品质，TIS-NM纳米涂层在到达用户手中时已经是成品，无需再进行其它加工，可以直接使用。
在运输方面TIS-NM纳米涂层具有安全运输证书，无VOCs，无氯，不破坏臭氧，具备ROHS、REACH认证，不燃烧，不，无刺鼻异味，储存安全，符合安全生产规定，这些方面某些水性三防漆也基本符合规定，只是纳米涂层的认证更，趋向于更安全的范畴。
固化时间区别比较大，水性三防漆一般是室温下20分钟左右表干，如果60-80度加热，约10分钟左右表干，纳米涂层室温下1-3秒表干，无需加热，水性三防漆完成固化时间是室温下20-24小时，加热完全固化需1小时左右，而纳米涂层完全固化时间是室温下1-3分钟，相对纳米涂层的固化时间要快速得多。
派瑞林涂层是化学气相沉积法，是反应物质在气态条件下发生空间气相化学反应，在固态基体表面直接生成固态物质，进而在基材表面形成涂层的一种工艺技术。派瑞林薄膜制备过程分为三步：单体的汽化、裂解、在基材表面进行附着沉积。
紫外线照射的薄膜与未曝光的薄膜之间的故障时间之间的巨大差异为聚对二C和N的正确使用条件提供了重要的认识。聚对二D，C，N，AF4的化学结构定义了由于紫外线引起的降解接触。聚对二N是未取代的烃分子，聚对二C每个重复单元具有一个加氯基，聚对二D每个重复单元具有两个加氯基。相比之下，聚对二AF4用氟原子取代了化学品苯环上的氢原子，从而大大增强了其紫外线稳定性。
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